Keroro s'est installé chez les Hinata. Il a retrouvé certains de ses compagnons dont le soldat Tamama. La vie quotidienne entre humains et extraterrestres, venus en conquérants, se poursuit dans l'agitation. C'est alors qu'apparaît le Caporal Giroro, l'invasion planifiée par le sergent Keroro pourrait, finalement, bien avoir lieu !
